Diakonie Evangelické církve metodistické byla zřízena v r. 1993 Valnou hromadou zakládajících členů a od roku 1996 je evidována jako organizační jednotka Evangelické církve metodistické (znak ECM + odkaz). Diakonie je specializovanou agenturou pro poskytování sociálních služeb církve. Z celospolečenského pohledu je Diakonie nestátní neziskovou organizací (NNO) působící v sociálně zdravotní oblasti. Zájemci o činnost Diakonie jsou sdružováni v Klubu přátel Diakonie.
V současnosti Diakonie ECM spravuje šest projektů - středisek, které poskytují převážně služby sociální intervence - kontaktní práce, poradenství, terapeutické komunity, krizová pomoc, azylové domy a v menší míře asistenční služby sociální péče - pečovatelskou službu. V budoucnu se služby rozšíří o poskytování rezidenčních služeb sociální péče - domov penzion pro seniory a chráněné bydlení.